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PG电子游戏- PG电子平台- 官方网站什么是NGS和建库的接头?

发布时间:2025-10-25 23:26:43  点击量:

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  分子标签的作用原理:同一个样本的DNA片段,每一个片段都带有一个特有的标签序列,它会随目标序列参加万里长征,他们一起经过文库构建、一起被PCR 扩增,然后一起被测序。最终测序得到的序列中,带有不同标签的序列,代表它们来自不同的原始DNA片段分子;带有相同分子标签的序列,代表这些序列都是从同一条原始的DNA片段扩增而来的。由于PCR和测序过程中的错误是随机发生的,因此根据这些分子标签,可以在去除冗余的过程中将PCR和测序等过程中带来的系统突变排除掉。利用分子标签进行数据分析,可以大大降低低频突变的假阳性率。

  测序RNA文库的两端需要不同的接头,一般叫P5和P7(我觉得是接头的一部分)。RNA建库的目的之一就是为了在每个DNA片段的两端加上这两个东东。假设随机在两端加p5或p7,就会有一半的片段两端加的是相同的接头(50%的概率),这种RNA文库是无效的,原因:在测序芯片flow cell上,两端一样的文库走不通正常的测序流程,提前作废了;另外,一般的建库PCR过程中,两端一样的片段,在变性后两端会biu在一起,引物竞争不上去,然后只能扩增个屁。

  是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(不包括 Small RNA)文库构建而设计的,能够确保接头的高效连接及文库的高产量,并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构,能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U,当 U 被 USER 酶(由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库,从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品,也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备法。

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